La calorimetría indirecta es un método por el cual las mediciones del intercambio de gases respiratorios (consumo de oxígeno y producción de dióxido de carbono) se utilizan para estimar el tipo y la cantidad de sustrato oxidado y la cantidad de energía utilizada por el organismo.
Se trata de una metodología no-invasiva aplicable a la investigación de fisiopatologías metabólicas, estudio del ejercicio físico, termogénesis y nutrición. La unidad consta de 16 jaulas para ratón o 10 jaulas para rata en las cuales se mide el O2 consumido, el CO2 producido, la ingesta y el movimiento ambulatorio de cada animal, lo que permite determinar la tasa metabólica, gasto energético, la proporción de sustratos energéticos (carbohidratos y lípidos) mediante el cálculo del coeficiente respiratorio y la actividad motora horizontal a lo largo del tiempo de experimentación.